楽しく仕事したいのに

あなたはどうしたいんですか？

この、シフトを削る、という行為が、育休を取得したためということからなら、それは会社側がまずい対応になるのでは？
不利益な取り扱いをしてはいけないことになっているはずなので。

また、取締役が人事に介入したことで解雇されたとのことですが、本当にそれだけで解雇されるのでしょうか。

秘書課の課長からの、あなたへの希望シフト調査は、単純に勤務時間管理の都合上必要なのもしれないし、きちんと1日何時間働きたい、ということは伝えた方がいいと思います。
あなたは何ができるの？の問いに関しては、秘書課での業務が初めてなのだから、周りの様子から学び、これから見つけて行くしかないですよね…

あとは、元の部署含め、他部署への異動を希望できれば、それも選択肢の一つとしてあるかもしれませんね。