労基に相談するべきなのでしょうか

主さんが労基に駆け込んだとしてその問題は解決しないと思いますよ。

「以後このようなことが無いよう気を付けてください」という喚起だけだと思います。場合によってはそういうＦＡＸだけで終わると思います。

それが労基です。労基は改善を促すだけの機関です。主さん側に立ち戦ってくれる機関ではないことを理解するべきです。

会社と戦うのであればお願いするのは弁護士ですよ。

ただその場合、最初の研修後給与形態が変わるという書面と実際の給与明細、それと勤務状況がわかるものが必要なると思います。

まあそれをすれば職場規定を持ち出され解雇になりますけどね。