熱が37度3分、休むか迷ってます

市販薬が飲めないとか、市販薬なんて、そんなに頼れるものじゃないし。
消炎鎮痛に的を絞れば、市販薬でも、極められそうじゃないかとは思います。熱は下がりますよ。

休んだほうがいいかは、お店と話し合うべきです。
電話番でもいいからいてほしいとなることもありますし、お客様あってのことだと、見た目にも不具合がありそうな人を表に出したくないこともあります。
企業イメージってあるので、接客に携わらせる人を厳選してるところもありますしね。

あなたが休むと、代わりにレジすらできない人しか残ってないのは、おかしい。
社員さんは、研修を受けてるはず。
代わりはいくらでもいるはず。

とんでもなく特殊な業務ではないんですし、大丈夫ですよ！
主さんのいるはずだった時間帯が、混雑するとは限りません。
レジミスより、その日の業務を辞退するほうが、ミスの処理もしなくていいとなることもあるかもしれないですしね。
レジミスとかで、経理方面の処理とか、面倒なこともありますので。