彼氏にお金を請求すると言われた 同棲解消

たらればでは話せませんが、初期費用などの支払いの折半を求められ、それに同意していれば支払わなければなりません。
現状は少しずつ支払いをしているのですから同意とみなし、賃貸に関しては支払いが必要です。

会社については、赤字があなたの為である旨を証明出来なければ無理でしょうね。
あなたが無理矢理に事業を続けさせていたり、給料を相場以上に高く貰っているなど無ければ事業を続けている彼の責任です。
雇用契約書についてはサインをしていないから何も知りません何でもオーケーは通用せず、一般的に常識と思われる事、例えば横領しない事や会社に多大なる損害を与えない事は働いた時点で合意とみなされます。
会社が従業員に対して請求出来る正式な損害賠償としては、従業員の落ち度が多大な場合です。
それでも最高で損害の2割程度ですよ。

あまり彼の言動に振り回されない方がいいと思います。
以上