農業高校から農学部に進学出来ないのはおかしい

工業高校や商業高校から大学進学も珍しくないし…受験科目に合格できる学力があるから合格するわけです。
要するにその農業高校の生徒の今までのレベルや志向の問題(進学を本気で考えないとか受験勉強に熱心でないとか)で、主さんは進学という目標があるわけだからそれを忘れず学生生活をおくればいいだけ。
専門知識云々なら中卒で大工修行を優先…は考えにくくない？分野の研究、学問追及で技能職追及とは少々方向が異なります。それでも主さんの体験や知識は受験科目に反映されないけれど、広く見れば一歩リードした強みは確かですよ。