通勤手当と通勤時間について…

経費についてと、交通費についての関係性を教えてください。
交通費を低く設定していても売上が少ないとは限らないというのは、なぜ？

交通費を高くても出してもいいというのは、どういう理由からですかね？
確かに出勤が厳しいから辞めるんじゃないか？という懸念？があるからですか？
売上と交通費の収支バランスが保ちにくいとかなのかな…？
けど、経費って皆、社員の会食を経費で落とすとかいいますよね？
あれって会社会計にするのはわかりますが、個人が払うのと会社会計で経費で落とすのは何がどう違うんですか？