辞めるのになぜ今さら・・・

主さんが支店長と約束して残留していても、主さんの上司がその意向を酌まずで不満なら、支店長と直接話をするのが筋です。
支店長と直接話をする方法がないなら、仕事の引き継ぎの必要はありませんから、さっさと辞めて欲しいのが上司の気持ちでしょう。
元々、主さんはとうに辞めている予定だったわけですから、今、主さんが教えたいと思う方が業務担当に着いていたのは予定通りなんでしょう。
そして、主さんの今の業務に穴が空いたから、単にそこに配属なだけです。
仕事を覚えることはさほどの重みはないでしょう。
上司には、支店長の意図は関係ないんだと思いますよ？
主さんは、身体を労るために退職するわけですから、無理に残留する意味はないと思います。
どうしても、支店長との約束を果たしたいのであれば、支店長と直接話をして、支店長にきちんと引き継ぎのできる状況にしてもらってください。
そこまでする事は、無駄だし、会社の業務なんてなるようになるので、主さんが心配することではないですけどね。